Multiplex-PCR zur Charakterisierung von APEC und anderen extraintestinal pathogenen E. coli (Ewers et al., 2007)

Multiplex-PCR_zur_Diagnostik_von_APEC
Multiplex-PCR zur Charakterisierung von APEC und anderen extraintestinal pathogenen E. coli (Ewers et al., 2007)

Zur Bestimmung des Virulenzgenmusters bei APEC sowie den extraintestinal pathogenen E. coli-Pathovaren UPEC (uropathogene E. coli) und NMEC (Neugeborenen-Meningitis E. coli wurden vier Multiplex-PCRs etabliert, mit denen folgende 33 Virulenz-assoziierte Gene nachgewiesen werden können.

  • Adhäsin-Gene:
    afa/draB = afimbriales Adhäsin; crl = Curli-Fimbrien; fimC = Typ 1-Fimbrien; hra = heat resistant agglutinin; iha = Eisen-reguliertes Adhäsin; papC = Pyelonephritis-assoziierte Fimbrie; sfa/foc = S-Fimbrie; tsh = Temperatur-sensitives Hämagglutinin; mat = Meningitis assoziierte und Temperatur-regulierte Fimbrie
  • Eisen-Akquirierungs-Gene:
    chuA = Hämin-Rezeptor; fyuA = Ferric yersinia uptake; ireA = putativer Catecholat-Siderophor-Rezeptor; iroN = Catecholat-Siderophor-Rezeptor; irp2 = Eisen-reprimiertes Protein; iucD = Aerobaktin-Synthese; sitD (chromos. u. episomal) = Salmonella Eisentransport-System
  • Protektine/Serumresistenz:
    cvi/cva = Colicin V Operon; iss = erhöhte Serumresistenz; neuC = K1 Kapsel-Polysaccharid; kpsMTII = Guppe II Kapselantigen; ompA = äußeres Membranprotein; traT = Transfer Protein
  • Toxine/Hämolysine:
    EAST = Hitze-stabiles Zytotoxin; cnf = zytotoxischer, nekrotisierender Faktor; sat = sezerniertes Autotransporter-Toxin; vat = vakuolierendes Autotransporter-Toxin; hlyA = hemolysin A
  • Invasine:
    gimB = genetische Insel assoziiert mit Neugeborenen-Meningitis; ibeA = Invasion des Gehirnendothels; tia = toxigener Invasionslokus         
  • Sonstige:
    pic = Serinprotease-Autotransporter; malX = Pathogenitäts-assoziierter Marker

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